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根據美國監測、流行病學和最終結果（SEER）數據庫的脊索瘤患者預后資料表明：脊索瘤患者預后明顯較差，脊索瘤患者中位總生存期為 12.6 年，10 年生存率為 54.7%。
脊索瘤通常起源于中線區域，而軟骨肉瘤起源于旁中線中央顱底，所以掌握周圍復雜的骨性解剖結構對于成功手術治療至關重要。 脊索瘤幾乎均以斜坡為中心，斜坡分為三個部分。斜坡上段起自后床突，沿著鞍背，終止于巖尖。這一區域臨近的重要神經血管結構包括動眼神經、滑車神經、三叉神經眼支和上頜支、頸內動脈海綿竇段、基底動脈上段和海綿竇。斜坡中段起自臨近Dorello’s管的巖尖，止于頸靜脈孔（神經部分）。這部分重要的神經血管結構包括面神經、前庭蝸神經、基底動脈下段、椎基底動脈匯合部和巖下竇。斜坡下段起自頸靜脈孔（神經部分），止于枕骨大孔。這部分包括基底動脈、枕骨髁、舌下神經管，以及舌咽神經、迷走神經、副神經和舌下神經。
經鼻內鏡入路是切除脊索瘤的理想入路，因為腫瘤位于硬膜外且不太可能呈纖維狀；通過局部顯微外科操作借助成角內鏡更適于切除腫瘤。此外，采用微創開顱入路切除顱底中線腫瘤，是不太可能達到的。
2019 INC國際神經外科醫生集團主辦的第二屆世界神經外科顧問團（WANG）年度峰會上，世界神經外科聯合會WFNS顱底手術委員會主席法國Sebastien Froelich教授講述了其對于顱頸交界處脊索瘤的手術策略，他指出：顱頸交界區脊索瘤比斜坡的預后情況要差，手術更加復雜，浸潤也更加彌漫性，全切也會更為困難。目前，神經內鏡下手術對脊索瘤的治療有了革命性進展，因為這是一個直接的手術入路，你可以直接達到腫瘤的部位。
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